Lain est une jeune lycéenne renfermée sur elle. Choquée par le suicide inexpliqué de sa camarade de classe Chisa, elle reçoit peu après le drame un courrier électronique provenant de Chisa!
Des phénomènes étranges vont dès lors se produire autour d'elle. Curieuse, la jeune fille décide de s'aventurer sur le Net à la recherche d'une explication à tous ces faits mystérieux. Au cours ses explorations, d'autres suicides vont suivre la mort de Chisa.
Tous ces disparus semblent avoir participé à un mystérieux jeu en réseau.
Au fur et à mesure, Lain sera également confrontée au mystère de sa propre existence. Et là, faut s'acrocher.
